Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC8A1P32418 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC8A1P32418 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC8A1P32418 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC8A1P32418 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms