Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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CTLA4P16410 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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CTLA4P16410 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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CTLA4P16410 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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CTLA4P16410 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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CTLA4P16410 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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