Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms