Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL477P-201ENST00000488440 286 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SKP195-201ENST00000516587 303 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 C8orf37-AS1-203ENST00000521905 617 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERPINB8-209ENST00000636430 1719 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEC22C-205ENST00000417572 1513 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRBOX4-203ENST00000377919 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNHG5-211ENST00000587692 1029 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM231B-201ENST00000600179 510 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL139260.3-204ENST00000621281 609 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 BIN3-212ENST00000640731 450 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCTP-202ENST00000325214 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 IDH3A-207ENST00000558554 1595 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 CXorf40A-203ENST00000422892 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 TACR1-202ENST00000409848 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALKBH2-202ENST00000429722 1159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC098934.2-202ENST00000438944 1033 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 CMC2-202ENST00000486645 766 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 ST3GAL1P1-201ENST00000513810 1014 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 CIRBP-AS1-201ENST00000585832 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00923-208ENST00000621777 503 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL4R-219ENST00000628578 201 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 SDR16C5-203ENST00000522671 1988 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAGLN2-201ENST00000320307 709 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNCG-202ENST00000372017 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST1H2BN-201ENST00000396980 432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 SALL1-204ENST00000566102 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPLOC4-214ENST00000573876 560 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL138828.1-208ENST00000585946 824 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAF7L-202ENST00000356784 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 SFTPA1-203ENST00000428376 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC26A5-201ENST00000306312 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 MED27-201ENST00000292035 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 HTR3D-202ENST00000382489 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALDH3B2-204ENST00000530069 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms