Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AC127496.3-201ENST00000576032 494 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms