Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 AL022318.4-201ENST00000381568 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC116337.3-201ENST00000505200 846 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 PPARD-205ENST00000448077 3516 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP25-203ENST00000409220 2939 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms