Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 TUBB8P9-201ENST00000422534 1276 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 TUBB8P10-201ENST00000430210 1279 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 PACRG-AS3-204ENST00000620150 567 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HERVK_113Q902F9 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms