Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms