Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PLD3Q8IV08 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms