Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms