Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CUL3Q13618 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CUL3Q13618 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CUL3Q13618 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CUL3Q13618 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CUL3Q13618 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CUL3Q13618 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CUL3Q13618 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CUL3Q13618 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CUL3Q13618 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CUL3Q13618 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CUL3Q13618 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CUL3Q13618 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CUL3Q13618 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CUL3Q13618 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CUL3Q13618 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CUL3Q13618 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CUL3Q13618 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CUL3Q13618 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CUL3Q13618 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CUL3Q13618 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CUL3Q13618 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CUL3Q13618 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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