Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 PPARG-206ENST00000397012 2006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCCD1P59942 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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