Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
AP3M2P53677 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP3M2P53677 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms