Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK8P49336 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK8P49336 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK8P49336 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms