Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP4AP20648 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms