Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMNAP02545 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMNAP02545 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMNAP02545 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMNAP02545 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMNAP02545 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMNAP02545 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMNAP02545 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMNAP02545 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMNAP02545 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMNAP02545 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMNAP02545 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMNAP02545 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LMNAP02545 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMNAP02545 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMNAP02545 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMNAP02545 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMNAP02545 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMNAP02545 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMNAP02545 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMNAP02545 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMNAP02545 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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