Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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