Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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