Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 LINC01624-203ENST00000607074 3265 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPF-202ENST00000356053 2670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPF-207ENST00000544000 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 TRAF5-203ENST00000367004 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 MMP19-206ENST00000548629 1813 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 GLYR1-212ENST00000591451 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 LINC00664-203ENST00000599078 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 RNF34-203ENST00000392465 2051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 MRO-203ENST00000428869 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 PRAMENP-201ENST00000337471 3038 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 CASP7-201ENST00000345633 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 SPACA6P-AS-201ENST00000602324 3962 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 LRFN5-201ENST00000298119 3723 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 MIGA2-201ENST00000358369 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 BMP2-201ENST00000378827 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 RTFDC1-202ENST00000357348 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 RABL2B-201ENST00000354869 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 DHX30-207ENST00000457607 3748 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 KCNAB1-215ENST00000618897 4437 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 ESPNL-203ENST00000409506 3610 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 REXO5-201ENST00000261377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP30-201ENST00000368013 4394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 RPS10P7-201ENST00000441932 2329 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 LRRC8E-201ENST00000306708 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 AC006037.2-201ENST00000622975 2232 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms