Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms