Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 L1CAM-202ENST00000361981 5004 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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