Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms