Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ATP2A3Q93084 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ATP2A3Q93084 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP2A3Q93084 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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