Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms