Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCDC142Q17RM4 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms