Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 SLC14A1-205ENST00000502059 2371 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 IGHG2-202ENST00000641095 2594 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 PLK4-209ENST00000513090 3123 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 KCNAB1-215ENST00000618897 4437 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 PLEKHG5-205ENST00000377740 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 SOX13-203ENST00000367204 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
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NBR1Q14596 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
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NBR1Q14596 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 ABL2-202ENST00000367623 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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NBR1Q14596 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 ELN-201ENST00000252034 3781 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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