Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 PTCD2-212ENST00000543322 2029 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 UNC93A-201ENST00000230256 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 GRIA4-202ENST00000393125 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCNIQ14094 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms