Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 LINC02328-202ENST00000554647 522 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 HRASLS2-201ENST00000255695 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC010136.1-201ENST00000450996 568 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC010319.2-201ENST00000594663 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 CLK2P1-201ENST00000416636 1294 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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