Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 FKBP4P1-201ENST00000507284 1347 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 CD9-212ENST00000610354 1315 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 RPL13AP5-201ENST00000439189 612 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC063924.1-201ENST00000546680 673 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 SLC26A5-203ENST00000354356 2686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 SERPINB8P1-201ENST00000401898 377 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 TUBB8P9-201ENST00000422534 1276 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 TUBB8P10-201ENST00000430210 1279 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC104623.1-201ENST00000446357 546 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 DSCR9-203ENST00000581640 472 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AL033381.2-201ENST00000603854 732 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC005519.2-201ENST00000554532 1367 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 TUBA3GP-201ENST00000410028 1325 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC010677.1-201ENST00000441690 412 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 LINC00299-203ENST00000444688 537 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AL357140.1-201ENST00000454104 424 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC008808.2-201ENST00000510349 569 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC092634.5-206ENST00000593670 812 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC022382.1-201ENST00000602768 336 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 SKINT1L-204ENST00000604015 540 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 TUBB8P5-201ENST00000445286 1351 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
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