Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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SRSF5Q13243 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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SRSF5Q13243 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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