Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACADSBP45954 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms