Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms