Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM21P19474 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms