Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 IKZF4-201ENST00000262032 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 TNFAIP3-211ENST00000621150 1613 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms