Protein–RNA interactions for Protein: B9A030

TISP43, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TISP43B9A030 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TISP43B9A030 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TISP43B9A030 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TISP43B9A030 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TISP43B9A030 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TISP43B9A030 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TISP43B9A030 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms