Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms