Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms