Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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