Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC15.05■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APTXQ7Z2E3 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms