Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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