Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABPAQ06546 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABPAQ06546 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms