Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms