Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC192P0DO97 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms