Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 INAVA-201ENST00000367342 4298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 PKP2-201ENST00000070846 4241 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 BEND3-202ENST00000429433 6654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 FNBP4-201ENST00000263773 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 CREB3L2-201ENST00000330387 7412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 FRMPD1-203ENST00000539465 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 DCTN1-201ENST00000361874 4500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 WWP2-201ENST00000356003 4227 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 LACC1-201ENST00000325686 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 ASAP3-201ENST00000336689 4050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 COPA-202ENST00000368069 4664 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 ANGPT4-201ENST00000381922 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 USP6-205ENST00000574788 8464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 SLC9A8-202ENST00000417961 6309 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TNP1P09430 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms