Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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