Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLKQ9UBT6 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.5 ms