Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms