Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRP2BPQ9P2M1 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms