Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 FKBP9-212ENST00000490776 2699 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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SPOCK3Q9BQ16 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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SPOCK3Q9BQ16 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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SPOCK3Q9BQ16 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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SPOCK3Q9BQ16 PTGER4P2-CDK2AP2P2-201ENST00000619442 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SPOCK3Q9BQ16 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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