Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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